邱城遗址位于湖州市北9公里的白雀乡小梅口。邱城遗址依山而建，共有两座规模略等、南北相连的城垣，分别将两座小山(均名邱城山)围在其中，城墙用泥土夯筑，相连略成“吕”字形。据清同治《湖州府志》载，邱城遗址是“春秋时吴筑三城之一”(邱城、彭城、吴城)。
邱城的东、南和西南部，有新石器时代遗址，邱城遗址总面积约3万平方米，分上、中、下3个文化层。下层，距今约6000多年，属马家浜文化。此层为较大的建筑遗迹。生产工具主要是石器，以背面弧突的锛和斜背舌表刃的穿孔斧最具特征。还有较多的镞凿、碓、针等骨质工具。
中层，距今约5000多年，属松泽文化。石器以扁平穿孔万斧和长条形石镑为主。生活器皿多为黑陶，包括鼎、豆、(上禾下皿)、罐、杯、解、筒形器等，形状规整，有些施有圆形和三角形的镂孔图案。上层，即城墙部分，1957年发现夯土中伴有印纹陶、原始青瓷、红陶、黑陶和石器、铜镞、玉(左王右夫)、玉璜等，最晚的是印纹陶和原始陶。
邱城遗址山东南文化堆积的上层，出土有夹砂绳纹陶鼎、三角形斜把石破土器、弧背有段石锛等遗物邱城遗址属马家族类型，1963年3月 11日，浙江省人民相关主体公布为省级重点文物保护单位。1981年4月13日，又重新公布为省级重点文物保护单位。