由于日本的教育体制与中国略有不同，日本所称的“研究生”并不是国内意义上的“硕士”，实际上只是大学、大学院的旁听生或履修生，很多时候我们也把日本的“研究生”定义为：硕士预科生。日本的“研究生”编制不一定属于硕士生院，实际上很多日本大学把“研究生”划入大学部。“研究生”阶段很难申请到奖学金及学费减免。在日本“硕士”的正式名称为“修士”，也叫“博士前期”。
日本留学研究生又分为两种，一为学部研究生，申请的资格为大学本科毕业及其预定毕业者，或者是满16年学习经历的都有资格申请。第二种为大学院研究生一般是硕士毕业以及其预定毕业者有资格申请。
日本研究期间为1年，最长能延长为2年。其间，每年有2次考修士的机会，考上修士课程者，办理研究生课程退学手续，转办修士入学手续。
申请研究生首先必须得到导师的肯许。日本大学里，导师对研究生以上学生的招生有非常大的决定权，如果事先没有得到导师接受的承诺，即使你直接向大学院招生处提出入学申请，大学院也不会根据你的情况为你指定专业或研究室。
学费
日本国立大学：约75万日元；
日本公立大学：约82万日元；
日本私立大学：人文科约100万日元；社会科学约103万日元；医学约109万日元；农学约115万日元。
学杂费
检定料（报名费）9，800日元、入学金84，600日元、研究料（学费）346，800日元/年。共计441，200日元，按100日元比6.5元人民币的汇率计算，合人民币28678元。此为一般情况，因大学而异会有所不同。
住宿费
日本国立大学一般设有国际交流会馆，租金低廉，多在5，900～10，000日元之间，因申请者多，不能保证赴日后立即入住；但可申请民间留学生宿舍，租金多在2～5万日元之间。按每月3万日元计算，年宿舍费合人民币23400元左右。此为一般情况，随汇率、宿舍种类有所不同。