黄鳝产卵在其穴居的洞口附近，产卵前口答吐泡沫堆成巢，受精卵在泡沫中借助泡沫的浮力，在水面上发育，雌雄鱼都有护巢的习性。黄鳝每年只繁殖一次，在每年的 4 一 8 月，盛期为 5 一 6 月。其产卵周期较长。黄鳝的繁殖季节到来之前，亲鳝先打繁殖洞。
一般洞打在田埂边，洞口通常开于田埂的隐蔽处，洞口下缘 2 /3浸于水中，分前洞和后洞。前洞产卵，洞长 10 厘米处比较宽阔，上下高约 5 厘米左右，宽约 10 厘米。后洞则细长，作隐蔽栖身。在较大的水体中或在不方便打洞的水域，亲鳝寻找茂密的水草、水草根、瓦砾、石缝等可隐蔽的物体做巢。
自然性比与配偶构成 黄鳝生殖群体在整个生殖时期是雌多于雄。其中2月份雌鳝占 91.3 % ，从 6一8 月雌鳝产过卵后性腺逐渐逆转，到9月份雌鳝逐渐减少到 38.3 % ， 10一12 月雌、雄鳝大约各占50％。在秋、冬季节，人们捕获黄鳝捉大留小，因此开春后仍是雌多雄少。
黄鳝的繁殖，多数属于子代与亲代配对，也有与前两代雄鳝配对。但在没有雄鳝存在的情况下，同批黄鳝中就有少部分雌鳝逆转为雄鳝后，再与同批雌鳝繁殖后代，这是黄鳝有别于其他动物的特殊之处。