海马效应可能与以下几个理论有关：半脑信息差：有科学家认为我们在处理信息时，两个半脑的处理速度是不同的，所以很可能会短暂的出现信息差，导致前一秒的场景，在下一秒好像得到了复述，就出现了熟悉的感觉。
记忆管理错误：我们的大脑中有一个用来储存记忆的区域，其中被分为了很多类型，当我们出现海马效应的时候，很可能是因为记忆存储到了过去记忆的区域，让大脑误认为是曾经发生过的事。
时空穿越：这一说法比较大胆，据说是在发生某件事后，中枢神经就以极快的速度传递给了记忆区，这时大脑还没来得及反应，当大脑在反应到记忆区的时候，就好像已经被重复过一遍，但事实上我们目前还没有确切的证据证明这一切。
脑部预知：据说很多时候，我们的大脑都在进行着场景的模拟练习，很可能隐藏在我们的潜意识之中，直到发生了相似的一幕时，潜意识就会强化情景，因此海马效应就会出现。