秋刀鱼功效多多好处多多，很多人都非常爱吃秋刀鱼，很多人发现在做秋刀鱼的时候会放柠檬汁，这个做法让很多人不解。柠檬汁一般有去腥味，除少量油腻外加调味的作用。不过原先是流行在日本料理，像吃秋刀鱼的时候，普遍在开吃前生切半个柠檬挤汁在食物上，用来去除一些鱼腥和调味。
秋刀鱼除了含有微量毒素以外，它并没有其它副作用存在，大多数人群都可以适量食用，只是那些患有肝硬化或者其他肝病的人群不适合食用秋刀鱼，不然会加重肝脏负担，不利于病情恢复。由于秋刀鱼中含有微量的毒素，孕妇如果食用秋刀鱼，会影响到胎儿，所以孕妇不宜吃秋刀鱼。
另外，由于秋刀鱼中有廿碳五烯酸，廿碳五烯酸的代谢产物之一是前列环素，该物质能够抑制血小板聚集，而肝硬化病人因为凝血因子生成障碍，血小板数量本来就较低，若进食含廿碳五烯酸多的鱼后，血小板凝聚作用再次被减低，就很容易引起出血，且难以止住。所以，肝硬化患者也不宜吃秋刀鱼。
秋刀鱼富含蛋白质、钙、廿碳五烯酸(EPA)、廿二碳六烯酸(DHA)等不饱和脂肪酸营养成分，经常食用具有明显的抑制高血压、心肌梗塞、动脉硬化的作用，同时促进身体免疫力，提高抵抗力，预防疾病。秋刀鱼中含有丰富的维生素A，而维生素A的主要功能之一就是维持正常的视觉功能，因此常吃秋刀鱼对于眼睛很有益处。