要做好甲鱼的孵化，首先要准备好甲鱼的孵化箱，对于甲鱼孵化箱可以购买也可以自制。自制的甲鱼孵化箱最好使用那些松树来做，因为松树有驱虫的功效，还有防潮湿、防腐烂以及防细菌的作用，且松树不会影响到透气性。在自制甲鱼孵化箱的时候，可以选择50cm左右的规格箱子。
在箱底打上几个孔作为滤水孔，上口可以打开变成倾斜状，这样在甲鱼孵化的时候方便养殖户观察。做好孵化箱，就要准备孵化用到的沙子了，在甲鱼孵化中使用到的沙子最好是河沙，因为河沙的透气性及传热性较好。选择好沙子后并不是直接就可以用的，应在使用前将沙子暴晒和煮沸消毒，这样就可以清除掉沙子中的细菌和虫卵。
沙子的湿度也是很重要的数值，养殖户可以在使用前用手来检测沙子的含水量，方法是用力握紧沙子的时候，不会有水流下，松开手之后，砂砾可以成团，不会散开即可。为了更好的孵化甲鱼，可以在孵化箱内部放置一些1cm的卵石。然后在卵石上面铺上一层毛巾，把水喷洒在毛巾上，具有保湿和保温的效果。
做好上述的甲鱼孵化前准备后，就可以进行甲鱼孵化了，此时需要孵化箱四周需要保持安静，环境的温度也需要稳定，慢慢等待小甲鱼的诞生吧。
在孵化完成之后，可以在孵化箱施设一些斜坡，供刚刚孵化出的小甲鱼玩耍。此时养殖户要注意做好室内的光照措施及通风处理，保证供氧量。