自然的木乃伊化是在极端的自然环境下防腐及长久保存尸体。一些尸体在极低温、或酸性、或极干旱、或盐度极高的环境埋葬下, 可以自然长久保存。像是恐龙木乃伊或酸沼木乃伊。有些科学家希望未来能取得木乃伊的基因后，透过复制技术，把它们的基因复制至新的活人。除了人类的木乃伊外，在古代和现代，均有动物木乃伊的例子。不少人希望以人工的防腐技术，来保存他们的宠物。
立即把最易腐内脏部分掏出。通在尸体的左开一个口子，把肝、胃和肠子等内脏全部拿出来，把死亡物的脑髓通过筛骨从鼻孔中抽出，但心脏不拿。因为古代埃及人认为，心脏是思维和理解的器官，必须留在体内。对内脏和体腔进行防腐处理，先用棕榈酒或椰枣酒将它们彻底清洗消毒，然后在内脏上撒一层捣碎的香料，把它们放进四个坛子里存放起来；对于消毒后的体腔，先填进用布包的泡碱和其它临时填充物，然后把它放置于干燥的泡碱粉里约四十天，最后细心地缝上刀口。
将已处理过的尸体涂上一层油膏或松香溶液，然后用白色亚麻布将指、掌、脚和驱干依次裹起来，死者的鼻子有时会因抽取脑髓而遭到破坏，这时要安上一个木制的假鼻子，眼窝里也要用布堵上或安上人造眼睛。把死亡物的两手交叉在胸前，装入石棺，有时还在外面再加上一个棺材盖。这样，一个木乃伊就完成了。
据美国国家地理网站报道，智利圣地亚哥大学考古学家在智利阿塔卡马沙漠中发现了迄今最古老的木乃伊——新克罗木乃伊。新克罗木乃伊比埃及木乃伊的历史还要古老几千年，不同于埃及人只为帝王和贵族制作木乃伊的做法，新克罗人会尊重每一位死者并为他们制作木乃伊。因为受到地球上最干燥气候的保护，长期掩埋在智利阿塔卡马沙漠中的新克罗人木乃伊依旧能够保留着原来的皮肤、毛发和衣着。