首先，对于古代封建王朝下的文成武将，要想获得重要和升迁，必须要获得皇帝的认可和支持。就秦桧来说，陷害岳飞的第一个原因，就是希望获得宋高宗赵构的认可和重要。众所周知，岳飞希望收复中原，并迎回“二圣”，这“二圣”就是指金人俘获的宋徽宗和宋钦宗。而对于宋高宗赵构来说，一旦这两位皇帝回来，自己又将处在一个什么样的位置呢？难道是让位于前两位皇帝吗？由此，赵构从本质上是不愿意岳飞真的“直捣黄龙”。
由此，对于秦桧来说，在明白宋高宗这位皇帝的心意后，所以才敢于以“莫须有”的罪名来诬陷岳鹏举等抗金名将。《宋史·岳飞传》记载：狱之将上也，韩世忠不平，诣桧诘其实。桧曰：飞子云与张宪书虽不明，其事体莫须有。就秦桧来说，只要获得了宋高宗赵构的支持，也即赵构想要处死岳飞，那么自己给岳飞按什么罪名并不重要。皇帝赵构前期重用岳飞是为了保护南宋的偏安，但岳飞走得太远，这就不符合宋高宗的意图了。
同时，秦桧之所以要陷害岳飞，也是因为后者触犯了赵构这位皇帝的大忌。岳飞个性刚强，不容易与人合作，并且容易说话得罪人。其中，最明显的是就是岳飞上书赵构，让他选定好储君，以此稳定臣心。自古以来，武将参与储君的册立可谓皇帝的大忌，万一岳飞和未来的储君联手，这皇帝肯定是不安的。并且，岳飞还有未经赵构批准就将兵权交给张宪等轻率的行为。为了迎合皇帝的意愿，秦桧不仅要和岳飞站到对立面，而且要对岳飞下手。
最后，另一方面，众所周知，对于宋朝这一朝代，重文轻武，对于武将的限制较多，而对于文臣则比较重要。但是，岳飞等抗金武将的重要，显然是不符合秦桧等文臣的利益。在中国古代历史上，文臣和武将之间的矛盾长期存在，比如三国时期的周瑜和张昭，再比如春秋战国时期的蔺相如和廉颇等。如果岳飞等人真的收复中原，其权力和地位自然大幅提升，此消彼长，这显然是对秦桧等文臣利益的削弱。