牦牛奶与牛奶的主要区别就是牦牛奶比牛奶营养价值更高，且腥味更重。牦牛奶中免疫球蛋白含量高，是牛奶所缺少的，长期饮用会有助于提高人体免疫力。牦牛奶含有人体所必需的18种氨基酸、共轭亚油酸、а-亚麻酸、花生四烯酸、维生素H等多种稀有营养成分，是普通牛奶所缺少的。牦牛奶的氨基酸、钙、维生素A含量分别比普通牛奶高15%、15%和6%。微量元素中，牦牛奶中所含的铁是普通牛奶的9.8倍、锌含量是普通牛奶的3倍、钙含量是普通牛奶的1.13倍。
牦牛乳是西藏人民的重要食品，具有极高的营养价值，它的特点是于物质和脂肪的含量高，风味独特，品质优良。对人体有益的Ca，Mg，Fe，Cu，Zn，Mn，K和Na等八种营养元素较为丰富。特别是Ca，Mg，K和Mn的含量较全国代表值近一倍钠元素含量高出20多倍。与普通奶粉比较，除了钾元素、铁元素含量低于普通奶粉外，其他六种元素的含量均高于普通奶粉。表明牦牛奶粉具有极高的营养价值。牛奶有大量免疫球蛋白能够帮助人体调节免疫力，提高抗病能力，同时它还是补钙的佳品，因为牦牛奶中富含天然乳钙。
不同品种奶中蛋白质含量范围为4.71%～5.73%。而普通牛奶中蛋白质含量通常在2.8%-3.3%之间。很明者比后者略高一些。牦牛奶中，含有牛奶所没有的大量“神奇因子’——共轭亚油酸。科学研讨标明，共轭亚油酸作为一种新型功用性脂肪具有抗肿瘤、抗氧化、抗动脉粥样硬化、强化免疫力、抑止脂肪堆积、降低胆固醇以及甘油三脂和低密度蛋白胆固醇、调理骨质密度、预防糖尿病等功用，对减肥和改善肌肉组织也有重要的作用。