黄鳝体内是有寄生虫的。黄鳝的生长环境是亚热带地区的池塘、小河、稻田等小流域，这种暖湿气候及地貌特征是极有利于寄生虫生长的，在这种环境中生存的黄鳝体内多多少少会有寄生虫存在，而虽然人工养殖的鳝鱼中寄生虫的含量相对较低，但其生长环境也不会有多么理想。因此，在食用时要防止寄生虫对人体的伤害，健康美味地享受这道味觉盛宴。
黄鳝体内的寄生虫主要是颚口线虫、棘头虫等，而黄鳝的血液中和消化道是寄生虫寄生的主要位置，在食用之前要将鳝鱼进行充分加热，当然去除掉内脏也十分必要，再经过充分的烹饪之后，确保鳝鱼肉熟透，这样就能杀死寄生虫，便能避免寄生虫感染。颚口线虫：颚口线虫的前端呈头球状，其上布满小棘，其余体表也布满小棘，体前部小棘呈鳞片状，能导致颚口线虫病，严重可导致癫痫、肢体瘫痪和脑疝。棘头虫：棘头虫在世界上分布广泛，大多数具有致病性，成虫寄生在脊椎动物体内，幼虫寄生在节肢动物体内，用吻钻入肠壁并发育成熟。毛细线虫：毛细线的虫体细长，长可达1米，成虫在海水或淡水中自由生活，幼虫寄生在节肢动物体内，可通过水源等感染人体引起铁线虫病。
黄鳝体内那么多虫子是哪里来的？这些虫子是什么？吃进胃里会怎样？金职院农学院水产养殖专家张根芳老师，带着学生一起解刨黄鳝，有了惊人的发现。
在一条野生放养状态下长大的黄鳝体内，张根芳和学生们解剖发现，它的肠子里有多达70条虫子，这些虫子像蝇蛆，是黄鳝体内最常见的棘头虫。“它们寄生于黄鳝体内，和黄鳝抢夺营养，会破坏黄鳝肠道。在野生黄鳝中，绝大多数鳝体内都有棘头虫寄生，一般少则几条，多的甚至上百条。”张根芳说。他们还发现一种细如丝线的虫子：线虫。线虫，一般出现在黄鳝肠道的后段，长度有5厘米，长的甚至达到10厘米左右。“多数线虫，会穿过肠壁钻入黄鳝的其他器官，严重的话会导致黄鳝内出血死亡。”