深海鱼油当中的DHA成分是脑细胞形成发育不可缺少的物质，它是另一种特殊的不饱和脂肪酸，有健脑益智的作用。因此DHA所扮演的角色是,促进、协调神经回路传导作用，以维持脑部细胞的正常运作，从而增强集中力、记忆力、注意力。保障血流畅通，深海鱼油中的EPA成分是一种特殊的不饱和脂肪酸，是有益于血液循环的保护因子。EPA可协助清除附着于血管壁上的胆固醇与硬化斑，降低血液中胆固醇水平，有助于保持血液畅通流动，抑制不正常血液凝集、预防血栓产生，阻止中风或心肌梗塞的发生。
EPA和DHA还具有抗炎活性。当人体摄入的Ω-6-脂肪酸(植物油中通常大量含有)过多而Ω-3-脂肪酸不足时，机体就会产生一些化学物质导致炎性反应。深海鱼油中的EPA与DHA则可以平衡过多的Ω-6-脂肪酸，因此鱼油常被用于改善各种炎症如类风湿性关节炎等。
EPA和DHA与情绪平衡有密切的关系。当血液中的EPA和DHA的浓度偏低时，发生轻～中度忧郁症的几率会明显提高。有实验表明，和不喜欢吃鱼的人比较，喜欢吃鱼的人面对困难更加积极乐观。这主要是鱼当中含有的EPA与DHA可以改善情绪。
深海鱼油中的“多烯酸乙酯”具有明确的降血脂、预防冠心病的效果，包含的EPA-E和DHA-E帮助促进血液循环及消除疲劳，清除血管内的垃圾，预防和治疗高血压。