帝企鹅一年仅仅繁殖一次，而这仅有的一次交配时长也只持续不到三分钟。虽然说命中率可能会很高，但‘兽性大发’的乐趣就会相对打折不少吧。雌企鹅在性交时会趴在地面仅以嘴和鳍支持身体。而雄性企鹅这时候会选择骑在雌企鹅身上，同时用力保持平衡。
生活史因种的体形大小不同以及地理分布而异。同一种类的繁殖周期还与纬度有关。有的种长途迁移到内陆的祖传营巢区去产卵，斑嘴环企鹅和小蓝企鹅一年繁殖2次，大多数种一年仅繁殖1次。而王企鹅则三年内繁殖2次。王企鹅和帝企鹅每次产卵1枚，而其他种则产2枚，偶为3枚。大多数企鹅在南半球的春夏季繁殖。巴布亚企鹅的某些种群也在冬季繁殖。帝企鹅发育时间长，故在秋季开始繁殖，以使幼雏在成活率机会最大的夏季产出。
当企鹅入群和离群时，常有种种表演和鸣叫。求偶配对时，常有求偶鸣叫，鸣声在两性之间有二态性。合恩角企鹅鸣声似驴鸣。到繁殖季节，帝企鹅能找到旧巢及旧配偶。除帝企鹅只由雄鸟担任外，所有种都由两性孵卵。在交配时企鹅群中十分热闹，鸣声聒耳，到孵卵时则一片寂静。卵和雏鸟的死亡率决定于气候条件、幼鸟在生殖种群的百分比和敌害等因素，一般为产卵总数的40-80%。产卵后，雌鸟常常离群到海洋觅食，约10-20天后回来替换雄鸟，以后便以一两周为期互相轮换。但雌性帝企鹅从鸟群到海洋需要走80-160公里，一直到64天孵卵期之末才能返回；此时正值南极严冬，雄帝企鹅互相依靠在一起，每个雄帝企鹅都会将卵置于足上孵化，并靠体内储存的脂肪生活；直到严冬过去，雌性帝企鹅回来后，雄帝企鹅将幼雏移交于雌性帝企鹅足上。
企鹅幼雏从卵壳孵出需24-48小时，孵出后即表现有取食行为，将嘴放入亲鸟口腔，取食成液状的吐出的甲壳类或鱼类食物。开始时，幼鸟藏在亲鸟身下；逐渐长大之后，幼鸟停留在亲鸟体侧。幼鸟从孵化到完全独立的期限，在较小的种要2个月，帝企鹅需5个半月，王企鹅12-14个月。半成熟的幼雏会成大群由成鸟照管，如在“托儿所”内一般。