金鱼鱼体发黑通常是因为水质不好、坚鳞病、食物中毒。引起的细菌感染，应考虑先消毒。先把病鱼隔离于盆子，在盆里加入少许漂白粉,浸泡消毒两个小时。鱼缸换新水,留少量水,倒入多点漂白粉,将泥沙翻动,浸泡12小时后换入新水,再浸泡12小时,之后加入干净水至八分满,将鱼放入。要保持良好的水质，需注意勤换水,自来水不能直接加，应沉淀几小时后再加入鱼缸。
坚鳞病。首先把病鱼隔离，把发黑的金鱼捞出放在一个小盆里。用黄粉100升5克的份量每天洗鱼身1次，清洗二周，其后再放4%的盐加2%青霉素泡鱼。食物中毒。一般会引发肠炎，导致鱼体发黑，可隔离病鱼，保持水质，静养，期间暂停喂食。查找毒源，避免再次中毒。金鱼患病之后，像细菌性肠炎病、细菌性烂鳃病、传染性出血病和一些肠道寄生虫病（棘头虫病、毛细线虫病）等，都会直接影响金鱼的食欲、消化、血液循环和呼吸等，影响到鱼鳞间色素细胞和银光细胞的正常繁殖活动，从而引起鱼体发黑，尤其是头部更为显著。
金鱼鱼体发黑的原因很复杂，除了金鱼本身为了适应环境的变化，鱼体颜色可发生变化之外。养金鱼的时候，如果气温骤降，水温突然降低超过金鱼的承受范围，会刺激鱼体，使体表黏液分泌功能失调。水质问题可以分为两个方面：一是水质老化，二是水质突变，前者是因为水体氨氮过高，后者是因为季节温差大，两者都会导致细菌感染，从而引起鱼体发黑。如果给金鱼吃了不对的食物或是药物，可能会引发肠炎，从而导致金鱼鱼体发黑。
金色、蓝色的金鱼变色极快，并且熠熠生辉。在投饲过程中，要控制它们的食量，一般控制在6～8成饱。如果在4成以下或8成以上，投喂时间长了，会营养失调，引起体表粘液分泌功能失调，金鱼就有体色发黑并生病的现象。建议你还是买个过滤器和增氧机，过滤下鱼缸的赃物。然后食物买那种褐色的有很重鱼腥味的颗粒，比较有营养，红色绿色那种都是加色素的，而且利润很高的！别被人骗了还不知道！