小丑鱼在产卵时要有足够的空间和隐蔽感，处于交配期的小丑鱼变得十分好斗，因此在小丑鱼到产卵期后将所有其他鱼移走，只留下小丑鱼及海葵。1～2个月后就会产卵，之后每15天会产卵一次，如不想让它们继续产卵，可隔离。小丑鱼产卵期到来的第一个征兆就是雄鱼在向前游动时，会上下跳跃。之后便开始收拾一个产卵的地方，有时它们会连续几天用嘴巴拱海葵下的石块，有时候它们会在鱼缸玻璃上产卵。
小丑鱼刚产下的鱼卵颜色同成鱼鳍上的鲜黄色一样，很快鱼卵变成橙红色，第六天时变成灰红色，然后鱼卵一端长出一个黑点，这便是眼睛的雏型，到了鱼卵孵化的那天或前一天，这些黑点变成了银灰色，这时鱼卵即将孵化，小鱼苗就要破卵而出了。
捕捉和释放小丑鱼幼鱼时要动作轻柔以防它们受伤，在把幼鱼放进培育缸时要小心地把装幼鱼的容器浸入水中，然后慢慢地把容器旋转出来，千万不要把幼鱼倒进缸中，那样会伤害它们，转移小丑鱼时保持黑暗有利于适应新环境，第二天不必开灯也不必喂食。要饲养小丑鱼需先为它打造一个舒适温馨的环境，找几块活石，为它搭建一个有天然屏障的小山洞，保持洞内有适当的水流通，洞内最好放一个椭圆的鹅卵石，洞口外贴着卵石。由于小丑鱼和海葵共生，所以最好找一个比较大型的海葵，置于洞口来保护小丑鱼。
饲养多只小丑鱼的时候尽量能同时入缸。小丑鱼买回来的时候，要先进行检疫，确认没问题后，即可入缸。需要注意的是小丑鱼适宜生存的水温是26～27℃，海水比重1.022～1.023，海水ph值8.0～8.5之间，水硬度7～9度，尽量把水质以及水温调到这个范围之内。