朱鹮的拉丁学名叫做“Nipponianippon”，直译就是“日本的日本”，以国名命名鸟名，足以看出它与日本的渊源。在19世纪，依靠发现地命名是当时的国际惯例，而作为东方的鸟类，朱鹮从日本走进了西方人的视野，才有了拉丁学名。朱鹮脱落的羽毛则被做成各种武器或仪式用具，比如箭羽，是当时日本贵族的爱物。日本天皇加冕时要用朱鹮的第一根翅羽作为饰品，朱鹮身上的朱红色也被当成日本的“国色”。
此外，在供奉日本天皇始祖天照大神的伊势神宫，每20年要举行一次“迁宫仪式”，仪式很繁复，其中一项就是给宫中之宝“须我流横刀”的刀柄上缠两枚朱鹮羽毛。羽毛的规格要求长度在5寸以上，宽1寸1分以上，色泽鲜明，左右对称。朱鹮（huan，二声），古称朱鹭、红朱鹭，是东亚地区的特有种，雄雌同形同色，成鸟全身羽色以白色为基调，但上下体的羽干以及飞羽略沾淡淡的粉红色，后枕部有长的柳叶形羽冠，额至面颊部皮肤裸露，呈鲜红色。
日本曾经是朱鹮分布最为广泛、数量最多的国家。关于针对朱鹮的保护与利用的法令法规也最早出现于日本。享保7年（1722），《饲鸟请负定书》中规定一些鸟类包括朱鹮在内等，一律不得私自猎取。
藩政时期（1868年前），日本对野生动物的狩猎活动限制较严，因此，朱鹮在当时相当常见。明治维新（1868）之后，废除藩政，禁猎的规定曾一度得到放宽，这就使得狩猎的人数迅速增加。日本朱鹮的数量在1868-1900年间急剧减少。二战后，1952年，日本在全国大面积进行调查，仅发现32只朱鹮，分别位于佐渡岛和能登半岛上。
