将新买来的线虫，养殖于清水中1-2天，每日换水数次（一般2-4次，视红线虫的清洁程度），只要水中出现杂物建议换水。目的是让红线虫吐干净腹内的污物。配置高锰酸钾溶液。专家们介绍的比例浓度，我们无法配置，因为精确到克的称量工具只有用天平。所以还是目测吧，一般桃红色溶液即可，消毒2-3分钟即可.
红线虫体内的细菌和寄生虫怎么办呢？将高锰酸钾消毒好的红线虫，静置2-3小时后，红虫重新回复活力，大部分又能重新集结成团了。用庆大霉素药粉（鱼市有卖的）放入红虫，拌匀。按每300ml水兑半粒花生米大庆大霉素的比例。放置半天后即可，参看2楼图片<5-7>。。高浓度的庆大霉素会杀死红虫体内的细菌，而且鱼儿吃了后也起到一定的肠道消毒作用。如果有人不想给鱼儿的肠道消毒，那你只需多再放置一天就好了。
红线虫消毒方法，对寄生虫没有作用。放入庆大霉素的红虫养殖缸静置半天以后，就可以放入“鱼类内生寄生虫专用药物”了（鱼市有售），这个比例一定要严格安装说明书的配兑比例进行，否则虫虫会死光光。然后再放置大约2-3天，每天都放药一次。
将新买回来的线虫漂洗干净后，用纱布淋出水分越干越好，容器中不能存有水分，放置于阴凉通风处，每天早晚各漂洗一次，可保存一周左右。线虫吐出的淤泥在温度20-度以上的时候会聚集在线虫的最底下，清洗的时候可将上面的活线虫卷起来，下面的淤泥和死亡了线虫的直接用水冲掉。冬季或温度较低的时候，淤泥和死亡了的线虫会浮在表面，不太好清理。如果将消毒后的线虫干放在容器中加盖密封半小时到一小时，死的线虫和淤泥就会在最下面，这样清理就比较方便了。
