吴君如与歌手杜德伟拍过拖，及后在台湾综艺节目《康熙来了》亦有承认。吴君如在陈可辛之前，曾跟杜德伟拍拖过，不过最后两个人的感情是无疾而终。吴君如自从1992年和男友分手后，有五年没有谈恋爱。她心目中的男人是那种高大威猛的类型，她怎么都没有想到最后走进自己生命中的竟然是温柔、书卷气十足的陈可辛。也许这就叫做缘分。
1990年认识了现在“香港十大导演”之一的陈可辛导演，两人从相识相知到相爱经历了一段漫长的长跑，吴君如说他的浪漫只会出现在电影作品里。
陈可辛爆料吴君如这个类型的女生并不是自己喜欢的类型，可就是这个爱笑爱闹的女生因为一杯水就走进了大导演的心中并预言你很快就会红的。
2004年吴君如和陈可辛开始了一段同居生活，80平方米的卧房被一块木门分割成两间，有共同生活也有各自的隐私，也许是因为不漂亮女孩的不自信，也许这样才能减少摩擦期的碰撞。之后吴君如在2006年生下女儿陈是知，陈可辛也在2007年电影《投名状》的首映典礼上挽着吴君如走过红毯。
所以陈可辛是吴君如的第一任老公，吴君如也只有陈可辛这一个老公。十年的爱情长跑，十年的相思相守，愿所有爱情都有圆满的结局可以长长久久。
吴君如说其实我都没有时间出去玩，度假时碰到的很多都是有女朋友的。可能是我要求比较高吧，反正我是发觉身边没有人追求我。
对陈可辛吴君如这样看：当时没想过，那时只是逛逛街，玩玩啊，没什么感觉。因为我喜欢特别高、特别壮的那种，陈可辛不是，他的外表像我的内心那么温柔。但是现在我非常爱他，他非常有才华，很有修养的，我非常崇拜他。我们现在和结婚是没有分别的，只是差生孩子而已。我们觉得只有想要孩子了才会结婚，他特别希望将来有时间陪他的孩子，可是他现在真的忙得不得了。
