在《碟中谍3》中兔脚是一个可以摧毁全世界的超级武器，影片暗示它是一种摧毁人类文明的“反上帝”，影片中这种兔脚是要运输到中东恐怖主义分子那里，也是相当于核武器的原材料。因为一时想不出来有什么比前两集（前两集分别是病毒）更加具有破坏力的武器，于是编剧就想到了用兔脚来代替。
兔脚来源于在中古世纪时期，西方人十分害怕鬼怪巫术这一系列歪门邪道的东西。在英国就有个传说，如果有人遭受到恶灵的侵犯，可以在午时月圆夜，把兔子的左后脚挂在自己脖子上，这样就可以起到保护作用。所以在西方人的眼中，兔脚就代表着「幸运」。
戴维恩启动伊森头部里的炸弹，本想借此夺回局势，但伊森忍住头痛将戴维恩推出诊所，让他直接被一辆货车撞死。伊森随后救出茱莉亚，但决定靠大型电击来解除自己头部的炸弹。电流使微型炸弹短路，没有爆炸，女主角在他电击后给他做心肺复苏和人工呼吸。
不可能任务情报局特务伊森·亨特经过多年刀锋舐血的日子后，决定正式退休并远离前线，以训练新进特务为主要工作，同时也和交往多时的护士女友茱莉亚·米德订婚，其并不知情伊森身为特务一事。伊森的订婚派对当晚，他的情报局行动主管兼好友约翰·马斯格雷夫通知说伊森所训练的学徒琳赛·菲瑞斯，在监视神秘军火贩子欧文·戴维恩的任务时被敌方抓获，希望伊森能暂时回归工作去营救她，以夺回关于戴维恩的重要情报。
为了拯救琳赛，伊森决定重装上阵，和马斯格雷夫挑选的队伍成员一起行动：当中有戴克兰·戈姆利、李珍、以及伊森老友路德·史提奇尔。众人来到德国柏林的废弃工厂里受大量敌军追捕，拿走两部损毁的笔电并救出琳赛。但在搭直升机逃亡途中，琳赛因为大脑里被德维恩植入小型炸弹胶囊被启动而开始剧烈头痛，伊森还未对她实行心脏电击来解除炸弹就目睹她身亡。
