刚开始使用水牙线，很臭，属于正常现象，牙齿是咀嚼的工具，一切食物都要通过牙齿进入胃消化，自然牙齿上就会有许多食物残渣。此外，水牙线较细可清洁牙齿缝上的污渍，不能用牙刷洗掉，这些污渍日积月累，水牙线有各种食物残渣留下的味道自然会产生异味。
牙臭是否代表有口臭：不一定，牙线在清理残余食物残渣时，会有食物残渣异味的产生，牙线臭只是表示牙齿脏。而且口臭是身体内部的问题，舌头是口臭的源头，只有身体内部的问题才能让舌头产生味道。但如果口臭太严重，由舌头分泌的臭味唾液仍然会影响牙齿，此时就会使牙线更加难闻。如果牙线没有异味是正常的话，如果味道太大就应该考虑口臭的问题。
用水牙线的好处：用水牙线比用牙刷更干净，不会有牙龈出血的现象。若使用前牙龈出血，也可通过水牙线改善出血，十分有效。水成柱状较细，且清洁力强，能有效地清洁牙齿上的污垢，有效地清洁残留在牙齿上的食物残渣所产生的臭味。用水牙线也能减轻牙齿疼痛，洗牙也能起到按摩的作用。此外，水牙线的日常清洁作用相当于洗牙一次，并且日常使用水牙线可以使牙齿变得更加干净，能有效地减少牙齿疾病的发生。
有没有可能用水牙线来代替牙刷呢？虽然水牙线可以清洁牙齿，但牙刷还是主要的清洁工具，尤其是电动牙刷更好用，那么肯定有人要问，带牙套能不能用电动牙刷，其实也可以用电动牙刷，几乎任何牙齿，电动牙刷都能搞定，但是水牙线却不能清洁牙齿以外的地方，两者比较起来，牙刷能起到更大的作用，水牙线能作为牙刷清洁的一种辅助，共同帮助清洁口腔。
