爬行动物与两栖动物显著的区别，主要体现在以下几个方面：
爬行动物产的卵是羊膜卵，而两栖动物产的是非羊膜卵；爬行动物体表被覆鳞片、盾或甲，缺乏皮肤腺，皮肤没有呼吸功能；而两栖动物皮肤光滑，没有鳞片、盾或甲；皮肤具有呼吸功能。
爬行动物没有肺皮动脉，而两栖动物具有肺皮动脉；爬行动物的生活史中没有变态，而两栖动物则有变态过程。爬行动物的颈椎分化比较复杂，不仅有环椎、枢椎的分化，而且还有数枚颈椎，而两栖动物的颈椎仅有1枚环枢椎。
两栖动物（学名：Amphibia）包括所有生没有卵壳的卵，拥有四肢的脊椎动物。两栖动物的皮肤裸露，表面没有鳞片，毛发等覆盖，但是可以分泌粘液以保持身体的湿润；其幼体在水中生活，用鳃进行呼吸，长大后用肺兼皮肤呼吸。两栖动物可以爬上陆地，但是不能一生离水，因为可以在两处生存，称为两栖。它是脊椎动物从水栖到陆栖的过渡类型。现在大约有三千多种两栖动物。两栖动物是冷血动物。
爬行动物属于四足总纲的羊膜动物，是对蜥形纲及合弓纲除鸟类及哺乳类以外所有物种的通称。在生命进化的过程中，爬行动物占有极其重要的地位。由于它的胚胎可以在产于陆地上的羊膜卵中发育，使其繁殖和发育摆脱了对外界水环境的依赖，是真正的陆生脊椎动物。人们常见的蛇、龟、蜥蜴、鳄鱼等均属爬行动物。
