虽然说墨龟任何食物都吃，但一直喂食便宜而营养价值低的食物，可能造成营养失调的现象，必须特别小心。墨龟需要大量的钙质，应喂食含有大量钙质的食物。最近市场上推出营养均衡的墨龟专用饲料，可以放心食用。此外鲤鱼饲料、狗食也是很适当的食物。偶尔喂食一些去骨的鱼内、蛇肉、老鼠等新鲜的食物，必能博得墨龟的喜爱。仅喂食鱼肉、肉片，会造成营养不良，需要添加水溶式的营养剂。以上所介绍的，是提供给经常栖息于水中的墨龟的食物，如陆龟等不下水、喜爱植物性食物的墨龟，较不适合使用人工饲料喂食。一般可使用叶菜、高丽菜、胡萝卜等蔬菜，配合营养剂来喂食。
水栖型的墨龟，可用水槽等能装水的容器来饲养。墨龟的实际体积比看起来大，运动量也很大，所以需要较大的笼子。平均而言，边长60厘米的水槽仍然太小，最好利用装衣服的储物箱来饲养。
墨龟不照射紫外线，同样也无法利用钙质。与蜥蜴比较起来，防止墨龟脱逃的设施较为简便，只要做好给水设施、有阴凉的地方休息，就不易发生中暑，进行日光浴的方式也比较简便。幼龟如果钙质摄取不足，龟壳容易变得柔软不堪;维生素A摄取不足，眼睛可能变白。当出现上述现象时，除了维生素A与钙质不足的问题外，可能还牵涉到长期喂食低营养的食物，紫外线不足等问题，可能是在饲养方法上出现错误。必须用心提供营养均衡的食物，利用太阳灯施行日光浴等，彻底改变饲养环境。
人工饲养的水栖墨龟，甲壳可能发生溃疡。虽然都是甲壳的病变，由于症状不同，病原菌的种类也不一样。革兰氏阴性菌。革兰氏阳性菌。症状有甲壳剥离、色素沉淀、溃疡、四技麻痹、脚爪脱落、内脏坏死等。螯虾、蛇、海蛆等作为饲料的动物，以及土壤、污染的水等，都可能是感染的来源。细菌经由擦伤的伤口进入体内。治疗时利用药浴，全身施以适当的抗生素。不过各种墨龟分别对某些抗生素有过敏的中毒现象，使用时需要特别注意。
