关于慈禧的死因，当时御医给出的说法是因为上了年纪而正常病逝，毕竟古代活到七十多岁已经是很不容易的一件事情，在这个年龄病逝实在是很正常的事情。也因为类似的原因，很长一段时间以来，大家都认为慈禧是正常病逝的。
然而，等到十九世纪六十年代时，有一个宫女在回忆录中却揭露了慈禧死亡的真实原因。这位宫女，据说是大太监李莲英的表姐。众所周知，李莲英是慈禧最信赖的人，所以李莲英的这位表姐，由此得以成为贴身伺候慈禧的宫女，并深得慈禧的信任。
当时这位宫女回忆说，慈禧死亡的真正原因，是因为慢性中毒，因为太医们在给慈禧检查身体时，发现其体内存在一些毒性物质，只不过为避免不必要的是非，所以太医们并没有说出来，而是把这件事隐藏起来，并对外宣称慈禧是正常病逝。
专家们对慈禧的尸骨进行了检测，发现其体内确实存在一些毒性物质，不过这些有毒物质不能算是毒药；再后来专家们通过查阅清朝留下来的各种记载文献，发现慈禧七十三岁的时候，患上了比较严重的痢疾，也就是拉肚子。
虽然拉肚子这个事情不算什么特别严重的病，问题是，一方面古代的医疗条件有限，另一方面当时是慈禧的年龄又太大，身体不是很好，所以这个病情一直靠喝药维持，并没有彻底治愈，慈禧也一直受到这个病痛的折磨，身体越来越虚弱。
