朱元璋陵墓在明孝陵地宫内。明太祖洪武大帝朱元璋和马皇后的陵寝，坐落于现在的南京玄武区紫金山南麓独龙阜的明孝陵，距今超过六百年的历史。相传独龙阜风水极佳，南朝梁代的名僧宝志禅师便安葬于此，这块宝地只能兴旺一人。于是朱元璋将宝志禅师的墓迁走。明孝陵始建于洪武十四年，永乐三年才正式竣工，历时整整25年，陵墓亭台楼阁全都具备，掩映于松柏常青之间，陵园整体结构是依山为陵，寓意天圆地方。
当年在陵园中还放羊了千余头鹿，每一头鹿的项下都挂着银牌，上书“盗宰者抵死”的字样。为了保护陵园不受侵害，明代列位皇帝还在这里驻扎一万多人专门用来看护陵园的军士。
明孝陵历经多次战火洗礼，尤其是在清代中期的太平天国战争中，明孝陵很多地表建筑都被同为汉族的太平军毁坏殆尽，只有部分石雕和砖石建筑得以幸存。后来的两江总督曾国藩也曾奉旨祭拜明孝陵，但因经费需要20万两，实在拨不出前，就用了七八百两纹银对明孝陵简单修缮。
有趣的是明孝陵虽是朱元璋的陵寝，但很长一段时间，没人能够确定朱洪武的地宫位置在哪里。而且传说中，朱元璋下葬时，13个城门同时出殡，让人真假难辨，所以洪武大帝的埋骨处，一直都是众说纷纭。直到1998年，南京当地的文物保护专家们利用现代的科技手段，精密磁测仪器勘验明孝陵，用了整整六年时间，耗费了无数心血，才解决了困扰人们600年的谜团。朱洪武的地宫在独龙阜地下几十米的深处，而且保存完好，没有出现被盗挖盗掘的迹象。
