一杯奶茶的热量大约是200-300大卡，脂肪含量6.3g/100mL，最高的一杯可达41g脂肪。含糖量是奶茶的弊端。正常甜度的奶茶，含糖量介于每杯11~62g之间，平均含糖量为每杯34g，都超过了《中国居民膳食指南(2016)》中建议的25g以下。最常见的是爱喝奶茶的人易发胖。奶茶常用糖调节口感，摄入过量糖会增加龋齿、超重肥胖风险。
而奶茶中的脂肪含量也偏高，尤其是奶盖茶平均脂肪含量达6.3g/100mL，最高的一杯可达41g脂肪。对于能量摄入2000kcal/d的健康成年人，建议一天的脂肪摄入量不超66克，一杯奶盖茶的脂肪量已接近推荐量的2/3。如大量饮用奶茶超过3个月，不仅血脂可能会升高，而且脂肪堆积在腹部，容易致人发胖。如此算来，一杯奶茶中的热量需骑车3小时来消耗。
人体每时每刻都在消耗能量，这些能量是由食物中的产热营养素提供的。食物中能产生热量的营养素有蛋白质、脂肪、糖类和碳水化合物。它们经过氧化产生热量供身体维持生命、生长发育和运动。热能供给过多时，多余的热量就会变成脂肪贮存起来，时间久了，身体就胖起来了。
热量消耗的途径主要有三个部分，第一部分是基础代谢率，约占了人体总热量消耗的65~70%，第二部分是身体活动，约占总热量消耗的15~30%，第三部分是食物的热效应，占的比例最少约10%，这三者的比例大致已经固定。
100g的珍珠中88%质量来自碳水化合物，可是消化纤维素和蛋白质的含量只有1g。如果是用牛奶制作的奶茶，选用脱脂牛奶的话，每100g牛奶的热量为35大卡，不添加糖分的茶水中每100g卡路里为1大卡。水果颗粒的热量虽然较高，但是富含维他命、矿物质和其他营养成分。